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核酸修饰

澳门新莆京app7906开发并建立了一种通过液相色谱-串联质谱定量分析DNA和RNA修饰碱基的方法,这是目前整体核酸修饰分析中唯一能够对极低含量修饰碱基准确定性定量的方法,可检测59种核酸修饰。
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所属分类
核酸修饰
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核酸修饰
DNA修饰
RNA修饰
甲基化
表观遗传学
1
产品描述

产品简介:

  核酸修饰是指在DNA、RNA碱基A\T\G\C\U以及核糖上的各种修饰,是表观遗传修饰的重要层面。是指在基因核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达可遗传变化,从而调控多种生理功能的一门遗传学分支学科。人体正常的生长发育与DNA甲基化水平的正确保持息息相关,异常的甲基化水平会导致相关基因的表达异常,进而诱导疾病。核酸修饰与多种疾病关联,主要包括:代谢性疾病、神经疾病、精神疾病、心血管疾病、骨质疏松、内分泌系统、肿瘤、衰老、皮肤疾病、炎症和免疫等。

成

核酸修饰RNA部分数据库列表

Index

Compounds

Abbreviation

Index

Compounds

Abbreviation

1

5'-deoxyadenosine

5-dA

11

5-formylcytidine

f5C

2

5'-Deoxy-5'-methylthioadensine

5-dmsA

12

5-formyl-2'-O-methylcytidine

f5Cm

3

8-hydroxyadenosine

8-oxoA

13

2'-O-methylguanosine

Gm

4

N4-acetylcytidine

ac4C

14

5-hydroxymethylcytidine

hm5C

5

N4-acetyl-2'-O-methylcytidine

ac4Cm

15

5-hydroxymethyluridine

hm5U

6

N6-acetyladenosine

ac6A

16

5-hydroxyuridine

ho5U

7

2'-O-methyladenosine

Am

17

inosine

I

8

5-carboxycytidine

ca5C

18

5-iodocytidine

I5C

9

N6-(cis-hydroxyisopentenyl)adenosine

cis-io6A

19

N6-isopentenyladenosine

i6A

10

2'-O-methylcytidine

Cm

20

2'-O-methylinosine

Im

 

核酸修饰DNA数据库列表

NO

Compounds

Abbreviation

物质

1

5-hydroxymethyl-2'-deoxycytidine

5-hmdC

5-羟甲基-2'-氧胞苷

2

5-formyl-2'-deoxycytidine

5-fdC

5-甲酰基-2'-脱氧胞苷

3

N6-methyl-2'-deoxyadenosine

6-mdA

N6-甲基-2'-脱氧腺苷

4

5-methyl-2'-deoxycytidine

5-mdC

5-甲基-2'-脱氧胞苷


技术优势:

  ♦ 检测种类多:精确检测59种核酸修饰;
  ♦ 灵敏度高:使用AB QTRAP® 6500+ LC-MS/MS,灵敏度可达ng/mL级;

应用方向:

  生长发育
  疾病诊断
  基因表达
  个性化治疗
  Biomarker筛选
  生物医药

样本要求:

  ♦ DNA:总量≥4μg/sample,浓度≥50ng/μL;OD 260/280≥1.8,OD260/230≥1.8;
  RNA:总量≥2μg/sample,浓度≥50ng/μL;OD 260/280≥1.8,OD260/230≥1.8。

 

  注:核酸溶解在超纯水中,OD260/280、260/230 达不到标准,但差距不大,其他条件符合要求,且样品呈不粘稠状态,可以用于核酸检测;

研究思路:

  Increased m6A RNA modification is related to the inhibition of the Nrf2-mediated antioxidant response in di-(2-ethylhexyl) phthalate-induced prepubertal testicular injury

  杂志:Environmental Pollution; IF:8.1

06-2

参考文献:

  Zhao TX, Wang JK, Shen LJ et al. Increased m6A RNA modification is related to the inhibition of the Nrf2-mediated antioxidant response in di-(2-ethylhexyl) phthalate-induced prepubertal testicular injury. Environ Pollut. 2020 Apr;259:113911. doi: 10.1016/j.envpol.2020.113911. Epub 2020 Jan 6. PMID: 31923814.

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