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label free定量蛋白组

定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是蛋白质组学研究领域最重要的应用之一。通过定量蛋白质组学技术,可以对样品之间的蛋白质水平的变化进行定量比较。由此获得蛋白质水平上关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。
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蛋白组
蛋白质组学
定量蛋白组
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产品描述

产品介绍:

  Label-free非标记定量技术是一种不依赖于同位素标记的蛋白质定量技术,该技术通过液质联用对蛋白质酶解肽段进行分析,无需昂贵的稳定同位素标签做内标,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样本中相应肽段的信号强度,就能对相应的蛋白质进行相对定量。其基本原理是基于肽段母离子提取峰面积(XIC),先鉴定样品中的肽段及蛋白质,再对鉴定到的肽段(蛋白)进行定量分析。利用非标记定量分析多个样品之间同种蛋白质的差异,成本低廉,操作简单,并且分析不受样品数目的限制,得到了广泛应用。

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Label free定量原理

技术优势:

  (1) 无需昂贵的同位素标记试剂,实验耗费低;
  (2) 对样本的操作最少,从而使其最接近原始状态;
  (3) 不受样本数量的限制,克服了标记定量技术对大批样本进行定量方面的缺陷。

应用方向:

  ♦ 医学研究
  疾病机理机制研究 诊断分子标志物 药物靶点;
  ♦ 动物研究
  动物生殖发育机制 动物疾病机理 动物营养代谢与调控 动物毒理研究;
  ♦ 植物研究
  植物生殖发育机制 非生物胁迫应答机理 植物抗病机理 作物改良;
  ♦ 微生物
  致病机制及耐药性研究 胁迫相关蛋白筛查及机制研究 环境作用机理。

样本要求:
 


研究思路:

  Lysyl Oxidase‐Like 4 Fosters an Immunosuppressive Microenvironment During Hepatocarcinogenesis

  赖氨酰氧化酶样4在肝癌发生过程中形成免疫抑制微环境

5-2

期刊: Hepatology,发表时间:2021.06,影响因子:17.425

研究背景:

  赖氨酰氧化酶样 4 (LOXL4) 是一种胺氧化酶,主要参与细胞外基质重塑,在 HCC 组织中高度表达,但其在介导肝癌发生中的功能作用却知之甚少。因此,本研究旨在研究LOXL4在肝癌发生中的作用。

研究思路:

5-3

研究结果:

5-4

蛋白组分析及STAT蛋白功能验证

研究结论:

  研究首先证明了在同时喂食胆碱缺乏、L-氨基酸确定饮食的小鼠的肝癌发生过程中,肝脏LOXL4表达增加,确定了LOXL4的促肿瘤作用。巨噬细胞在体外暴露于LOXL4会引发免疫抑制表型并激活程序性死亡配体1(PD-L1)表达,从而进一步抑制CD8+T细胞的功能。注射LOXL4可促进巨噬细胞浸润到肝脏并加速肿瘤生长,过继性T细胞转移或PD-L1中和进一步消除了这种情况。随后无标记蛋白质组学分析表明,LOXL4 对巨噬细胞的免疫抑制功能主要依赖于干扰素(IFN)介导的信号转导和转录依赖性PD-L1激活的激活剂。过氧化氢清除剂或巨噬细胞上的铜螯合消除了LOXL4的IFN介导的PD-L1呈递。在人类HCC组织中,CD68+细胞中LOXL4的表达与PD-L1水平呈正相关。CD68+细胞中LOXL4的高表达和肿瘤组织中CD8A的低表达共同预测HCC患者的较差生存率。总之,研究确定了LOX蛋白LOXL4在肝癌发生中的作用,断言LOXL4在肝癌发生过程中在促进免疫抑制微环境中起重要作用。

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