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TMT/iTRAQ定量蛋白组

定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是蛋白质组学研究领域最重要的应用之一。通过定量蛋白质组学技术,可以对样品之间的蛋白质水平的变化进行定量比较。由此获得蛋白质水平上关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。
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关键词:
蛋白组
蛋白质组学
DIA
1
产品描述

产品介绍:

  TMT(Tandem Mass Tags)技术和iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)分别是由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。TMT包含最多16组稳定同位素标记试剂,iTRAQ包含最多8组稳定同位素标记试剂,每组试剂由报告离子、平衡基团、反应基团组成,报告基团、平衡基团和反应基团,其中反应基团可与肽段的游离氨基反应,而每组标记试剂的报告离子与平衡基团的质量和相等。在一级谱图中,来自于不同样本的同一肽段,标记后表现为相同的质荷比。在二级谱图中,报告基团、平衡基团和反应基团之间的键断裂,带不同同位素标签的同一肽段产生质量不同的报告离子,根据报告离子的丰度可获得样本间相同肽段的定量信息,再经过软件处理得到蛋白质的定量信息。TMT/iTRAQ 标记定量一次上机可以对多达 16(8)个不同样本进行蛋白定量比较,标记效率高,可以对样本中的几乎所有蛋白质进行标记,质谱检测灵敏度高,可检测出低丰度蛋白,适用范围广,广泛应用于科研领域。

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技术优势:

  (1) 一次上机可以对多达 16个不同样本进行蛋白定量比较;
  (2) 不同标签混合后上机,具有较好的平行性,避免技术误差,提高检测效率;
  (3) 标记效率高,可以对样本中的几乎所有蛋白质进行标记;
  (4) 质谱检测灵敏度高,可检测出低丰度蛋白;
  (5) 适用范围广,可标记动物、植物、微生物、临床、体液或细胞等多种样本类型。

应用方向:

  ♦ 医学研究
  疾病机理机制研究、诊断分子标志物、药物靶点
  ♦ 医动物研究
  动物生殖发育机制、动物疾病机理、动物营养代谢与调控、动物毒理研究
  ♦ 医植物研究
  植物生殖发育机制、非生物胁迫应答机理、植物抗病机理、作物改良
  ♦ 医微生物
  致病机制及耐药性研究、胁迫相关蛋白筛查及机制研究、环境作用机理

样本要求:
 


研究思路:

  Quantitative Temporal Proteomic Analysis of Vaccinia Virus Infection Reveals Regulation of Histone Deacetylases by an Interferon Antagonist

  蛋白组学分析发现抗痘苗病毒感染的限制因子

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期刊:Cell Rep.,发表时间:2019.05,影响因子:9.423

研究背景:

  牛痘病毒(VACV)是一种大型双链DNA正痘病毒,与天花的病原体天花病毒(Moss,2013 年)遗传相关。正痘病毒之间的抗原相关性导致对异源感染的交叉保护,并解释了为什么VACV是一种有效的天花活疫苗,最终在1980年根除这种疾病。随着天花的根除,对VACV的研究仍在继续,因为它是研究病毒与宿主相互作用的极好模型,并且因为VACV正被开发为针对其他传染病的活疫苗的载体和溶瘤剂。为了提高VACV作为疫苗的安全性并优化其免疫原性,需要全面了解VACV的生物学及其与宿主细胞的相互作用。

研究思路:

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研究结果:

3-4

VACV感染的定量分析

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多种胶原蛋白,原钙粘蛋白和先天免疫调节蛋白下调

研究结论:

  本研究使用蛋白质组学方法确定了VACV细胞靶标,并将蛋白质C6(一种多功能IFN拮抗剂)定义为诱导多种宿主限制因子蛋白酶体降解的因子。除了抑制IRF-3激活和I型IFN诱导的信号传导外,C6诱导的HDAC5降解增加了VACV编码的功能,以逃避病毒限制。

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