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4D-DIA定量蛋白组

4D蛋白质组学技术在传统的保留时间、质荷比、离子强度的基础上增加了第四维离子淌度的信息,以研究蛋白质的表达水平,由此获得蛋白质水平上关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。
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关键词:
蛋白组
蛋白质组学
4D蛋白组
离子淌度
1
产品描述

产品介绍:

DIA(Data-independent Acquisition,数据非依赖采集)策略则是将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,并循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测,因此可以无遗漏地获得样本中所有离子的全部碎片信息,缺失值更少。但传统DIA的数据采集策略会使得谱图高度复杂,给数据解析带来极大的挑战,并且其定量可靠性也存有一定的争议。4D-DIA技术借助timsTOF Pro2特有的双TIMS设计和DIA-PASEF®采集模式,检测灵敏度在传统DIA基础得到了提升。由于4D-DIA技术的定量信息比传统DIA多了一维离子淌度信息,使得定量结果更准确,定量可重现性更好。

4D蛋白组原理示意图

4D蛋白组原理示意图

技术优势

(1)覆盖度更深,尽量不丢失蛋白质;
  (2)定性更准确,结果可信度高;
  (3)更稳定,定量更准确,数据更可靠;
  (4)通量高,满足大队列项目;
  (5)低样本量,更好满足临床样本少等问题。

4、技术优势

应用方向:

♦ 医学研究
  疾病机理机制研究、诊断分子标志物、药物靶点
  ♦ 动物研究
  动物生殖发育机制、动物疾病机理、动物营养代谢与调控、动物毒理研究
  ♦ 植物研究
  植物生殖发育机制、非生物胁迫应答机理、植物抗病机理、作物改良
  ♦ 微生物
  致病机制及耐药性研究 胁迫相关蛋白筛查及机制研究 环境作用机理

样本要求:


研究思路:

11

COVID-19 疾病早期的免疫抑制

期刊:Nature Communication,发表时间:2021.11,影响因子:14.919

研究背景:

北京大学医学部精准医疗多组学研究中心黄超兰主任团队,中国科学院高福院士团队等人开展协同研究,使用4D-DIA(DIA-PASEF)蛋白质组学技术,发现早期的新冠感染患者存在着显著的免疫抑制,并首次提出COVID-19的发病机制或存在“两阶段”模式。

研究思路:

、研究思路1

研究结果:

研究结果

免疫系统在新冠肺炎病的早期受到抑制

研究结果1

重症新冠肺炎病患者的免疫反应被激活

研究结论:

该工作采用了4D-蛋白质组方法,揭示了感染初期免疫抑制和COVID-19患者紧密相关。与早期相比,在感染的后期,免疫反应在一定程度上被激活。这些研究提供了与COVID-19疾病相关的分子变化图谱,并为可能发生的两期发病机制提供了线索。

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