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转录组+蛋白质组

RNA和蛋白质从转录层面和蛋白层面表征基因的变化情况,对样本分别进行转录组和蛋白质组检测,筛选差异基因和差异蛋白质,从两个分子层面来展现基因的表达情况,可以实现低丰度+功能信息的优势互补。
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关键词:
转录组
转录组测序
RNA-Seq
mRNA
蛋白质组
1
产品描述

产品简介:

  基因组,转录组,蛋白质组,代谢组等单一组学分析方法为动植物生长发育过程提供丰富的数据信息。但是生命系统是多组分互相联系的有机体,是高度复杂的庞大系统,单一组学的研究只能识别单一的变化,不能发现导致变化的原因,也无法研究复杂生物过程的相互联系。需要从多层次和多因素相互作用的全局性角度进行整合研究,才能完整地认识和揭示生命的复杂生理活动。

  RNA和蛋白质从转录层面和蛋白层面表征基因的变化情况,对样本分别进行转录组和蛋白质组检测,筛选差异基因和差异蛋白质,从两个分子层面来展现基因的表达情况,可以实现低丰度+功能信息的优势互补。

项目流程:

07转录组+蛋白质组1

信息分析:

007转录组+蛋白质组2

分析结果展示:

 07-转录组+蛋白质组-官网

研究领域:

  • 植物生长发育机制研究
  • 植物生物胁迫机制研究
  • 植物非生物胁迫机制研究
  • 蔬果花卉色泽营养代谢研究
  • 药用植物功能活性成分通路探究
  • 动物遗传育种
  • 动物营养品质研究
  • 动物疾病研究
  • 肿瘤的发生发展机制
  • 复杂疾病分子机制研究
  • 药物作用靶点及机理研究
  • 胚胎发育研究
  • 环境毒理研究

技术参数:

RNA技术参数

转录组+蛋白质组技术参数图替换3.

蛋白质组样本要求参考具体蛋白质组产品

  注:送样时,转录组、蛋白质组样本混匀后分成两管进行送样,避免后期因为分管导致的样本冻融。

研究思路:

 007转录组+蛋白质组8

期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry,IF:4.192
发表时间:2019年3月27日,研究单位:中国植物基因研究中心研究

00123

研究结论:

  木薯是一种重要的热带/亚热带粮食作物,其产量受到干旱的严重制约。本研究采用转录组测序和iTRAQ蛋白质组学技术。在木薯叶片和根中分别鉴定出1242/715个差异表达基因(DEGs)和237/307个差异表达蛋白(DEPs)。DEGs和DEPs主要在mRNA和蛋白质水平上单独调控,只有少数在干旱条件下被普遍调控,说明它们主要参与转录后调控。随后,分析了这些特异或共同调控的DEGs和DEPs的功能,并对热休克蛋白、次生代谢生物合成和激素生物合成相关基因的转录后调控进行了分析。本研究作为木薯转录组学和蛋白质组学分析的首次研究,为干旱胁迫下木薯的转录后调控提供了新的方向。

参考文献:

  Ding Z , Fu L , Tie W , et al. Extensive Post-Transcriptional Regulation Revealed by Transcriptomic and Proteomic Integrative Analysis in Cassava under Drought[J]. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2019.

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