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为什么不同批次、同一样本不同物质不能比较(举例)?

因为代谢组检测仪器与测序仪不同,需要定期矫正,因此不同批次间样品不能进行比较,例如去年老师6个样品进行了广靶检测,今年又送样6个进行广靶检测,不能将这12个样本一起分析。

因为广泛靶向代谢组检测为相对定量,不同物质的离子化程度不同,如果物质易离子化,那么含量低也会出现离子响应程度强的情况,然而不易离子化的物质,含量高也会出现离子响应度低的情况,因此不同物质间不可以进行比较,只能进行同一物质在不同样本中的比较。比如同一项目中,可以比较A物质在样本一、二等中的含量趋势,不能比较A、B两物质在样本一中的含量高低。

数据库没有的物质怎么检测?为什么物质数据库有但是老师样本检测不到?

如果老师关注的物质不在数据库中,建议老师购买标准品,进行靶向物质开发。
物质数据库中有但老师样本没有检测到的原因:
1.该物质在老师样本中不含有或者含量极低;
2.广泛靶向代谢组是一种高通量检测技术,一次性扫描上千种物质,质谱有离子抑制效应,离子对之间有互相干扰的问题,所以可能会存在检测不到的情况。

 

为什么要混样,怎么混样?

为了避免个体差异所引起的代谢物检测差异不准确,代谢组检测建议混样,既每个生物学样品原则上来自至少3个以上材料混合,作为一个生物学重复。

样本为什么要冻干,具体怎么做?

为避免新鲜组织样品在操作过程中代谢物不稳定造成降解,需对样品进行冻干处理,一般采用真空冷冻干燥的方法进行。

市面上代谢组常见6个重复,为什么我们广靶3个,可靠性怎么样?

因为其他公司用的Tof检测平台,该平台对于定量具有先天的劣势。
澳门新莆京app7906利用QTrap检测平台,结合开发的检测技术,定量准,重复性好。

筛选差异代谢物标准

选取fold change≥2和fold change≤0.5的代谢物。代谢物在对照组和实验组中差异为2倍以上或0.5以下,则认为差异显著。若样品分组存在生物学重复,在上述的基础上,选取VIP≥1的代谢物。VIP值表示对应代谢物的组间差异在模型中各组样本分类判别中的影响强度,一般认为VIP≥1的代谢物则为差异显著。

什么是初生物质和次生物质?

初生物质是维持生命活动和生长发育所必须,例如糖类、脂质、氨基酸、核苷酸等。

次生物质更多参与植物抗病、抗逆等环境应答,参与植物营养合成与功能活性相关例如酚类(黄酮、简单酚类、醌类等),萜类(类胡萝卜素、青蒿素、皂苷、苦味素、甾体),含N化合物(生物碱、胺类、非蛋白氨基酸等),其它(硫甙糖苷等)。

常见物质检测平台(NMR,LC,GC),哪些常见物质适合什么样的平台?

NMR:Nuclear magnetic resonance,核磁共振技术,具有样本无损伤性,不需要复杂的前处理,生物样本接近生理条件等优点,但是灵敏度低,难以检测到丰度较低的代谢物;对于能检测到的但低含量的代谢物信号较弱。

LC-MS:液相色谱与质谱联用技术,分辨率相对较高,灵敏度较高,检测种类较多,无需衍生化等优点,检测不挥发性的、极性化合物等,1000Da以内的小分子化合物。

GC-MS:气相色谱与质谱联用技术,主要针对挥发性物质进行鉴定,种类有限,分析样本多需要衍生化处理,主要集中在极性较低,分子量相对较小的代谢物(<300Da)。

其他公司非靶数据库与我们澳门新莆京app7906广泛靶向数据库的区别在哪?

1、其他公司 2000个标品库是综合植物、动物、微生物等各物种混合的结果,真正属于人及哺乳动物的代谢物数量很少,除去植物和微生物的能有几百个就不错了;我们的广靶库里这 2.5k+代谢物是专门以人为主体而建,具有更强的针对性。

2、从检测原理上来讲,非靶的灵敏度较低,在全扫描模式下很多含量稍低的物质根本无法检测到。非靶的数据库只在物质定性的时候起作用,而许多物质根本不出峰,建的库再大也无法进行匹配;我们的广靶采用的是 MRM 的检测模式,会对数据库中的物质进行逐个的检测,灵敏度远高于非靶,对于低含量的物质我们同样能够检测到,您最终得到的有效信息量会大很多。

3、我们的数据库中的物质类别较为全面,涵盖氨基酸、碳水化合物、脂质、维生素、 辅酶等多种类别,且每类物质都有着强大的生物学功能。

4、我们的广靶库能广泛覆盖到 kegg 中的关键代谢 pathway,检测结果能够更好地富集到通路中进行分析,从而根据通路中的关键酶和基因来开展一系列的后续研究。

非靶代谢组与广泛靶向代谢组有什么区别?

1、非靶库中虽然包含上万种代谢组,但是其中包括动物、植物、真菌、细菌、药物、多肽等物质;广靶库里这 2.5k+代谢物是专门以人为主体而建,具有更强的针对性。

2、非靶库数据来自全世界很多液质平台,不同平台存在较大差异;广靶数据库我们公司自建,能保证平台一致,物质定性更为准确。

3、咱们应该关注实际检测到的物质,广靶有效信息量达1000-1300+,而非靶只能定性得到200-400+。

4、我们新推出了 TOF-MRM 产品,对样本既进行了非靶检测,又将筛到的差异代谢物结合我们自建的广靶数据库进行了靶向检测,覆盖面更广,通量更高。

氧化脂质和脂质有什么区别?

氧化脂质属于八大类脂质中脂肪酰类,但因其含量低且同分异构体多,用一般的脂质提取方法不能有效提取,需要单独建立一套提取及检测的方法。此外,氧化脂质很容易被氧化,在实验过程中需要低温、避光操作。

功能性脂质组都有哪些功能?

功能性脂质组的特性与在细胞中的功能的关系是通过了细胞膜和磷脂双分子层的密切相关。从而构成了细胞膜的主要成分也是磷脂,磷脂双分子层构成细胞膜的基本骨架是具有流动性的。细胞膜的结构组成下面来给大家介绍下,其中功能性脂质组是磷脂双分子层。脂肪也是经常见的一种脂质基本上是属于大分子物质,也是需要经过消化从而转变称小分子物质甘油和脂肪酸之后才会通过细胞膜然后被细胞所吸收。功能性脂质组因为细胞膜中的磷脂双分子层是于出入细胞膜中的脂是结构比较像的物质,所以根据比较相溶的原理,脂质分子经过了消化之后的产物是可以轻易的就通过细胞膜的。

 

功能性脂质组的相似相溶原理中的相似说的是溶质与溶剂在结构上的相同。相溶说的是溶质与溶剂之间的互溶。相似相溶的原理也就是因为极性分子质检的电性作用,让极性分子组成的溶质与溶剂相互相溶。

 

功能性脂质组的相似相溶原理指的是因为极性分子之间的电性作用,让极性分子组成的溶质很容易溶于极性分子组成的溶剂,如果是比较难溶于非极性的分子组成的溶剂。非极性分子组成的溶质是很容易溶于非极性分子组成的溶剂,也很难溶于极性分子组成的溶剂。

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