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宏基因组
宏基因组测序是指对微生物全部基因片段进行测序的研究方法,它能够同时检测样本中的所有微生物信息。可用于研究样本中微生物群落组成,丰度差异、功能活性、以及与环境之间的协作关系。
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扩增子
扩增子测序是一种通过引物对特定区域进行扩增,再对特定长度PCR产物或者捕获片段进行测序,可用于研究样本中微生物群落组成及其丰度差异。根据研究对象的不同可分为16S/ITS/18S测序。16S测序可以鉴定特定环境中细菌的种类和丰度,ITS/18S测序可以鉴定特定环境中真菌/藻类的种类和丰度。
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真核转录组测序
转录组测序,指利用高通量测序技术,全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下的所有mRNA的序列信息。并对mRNA的结构和表达信息进行分析。
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全转录组测序
全转录组测序,可同时对同一样本中具有编码功能的mRNA和具有调控功能的非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)包括small RNA(以miRNA为代表),长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)和环状RNA(circular RNA, circRNA)进行测序,并对这四者之间复杂的相互作用关系进行分析。
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LncRNA测序
LncRNA测序是研究已有参考基因组的物种的特定组织或细胞在某个时期转录出来的所有LncRNA和mRNA的研究方法。
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