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4D-label free蛋白组

4D蛋白质组学技术在传统的保留时间、质荷比、离子强度的基础上增加了第四维离子淌度的信息,以研究蛋白质的表达水平,由此获得蛋白质水平上关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。
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关键词:
蛋白组
蛋白质组学
4D蛋白组
离子淌度
1
产品描述

产品介绍:

  Label-free定量蛋白质组学技术因为其操作简单、不依赖于昂贵的标记试剂、单次实验不受样品数限制等独特优势而备受广泛重视。但传统的label-free技术由于受质谱仪灵敏度和扫描速度等性能的限制,在不分级的情况下检测深度往往无法达到科研要求,因此大多数人采用诸如TMT/iTRAQ的标记定量方法。4D label-free技术借助timsTOF Pro2特有的双TIMS设计和ddaPASEF®采集模式,检测灵敏度在传统label-free基础得到了约12倍的提升。由于4D label-free技术的定量信息比传统label-free多了一维离子淌度信息,使得定量结果更准确,定量可重现性更好。

4D1

4D label-free定量示意图

技术优势:

  (1)覆盖度更深,尽量不丢失蛋白质;
  (2)定性更准确,结果可信度高;
  (3)更稳定,定量更准确,数据更可靠;
  (4)通量高,满足大队列项目;
  (5)低样本量,更好满足临床样本少等问题。

  4D2

应用方向:

  ♦ 医学研究
  疾病机理机制研究、诊断分子标志物、药物靶点
  ♦ 动物研究
  动物生殖发育机制、动物疾病机理、动物营养代谢与调控、动物毒理研究
  植物研究
  植物生殖发育机制、非生物胁迫应答机理、植物抗病机理、作物改良
  ♦ 微生物
  致病机制及耐药性研究、胁迫相关蛋白筛查及机制研究、环境作用机理

样本要求:


研究思路:

  Ultrafast and Reproducible Proteomics from Small Amounts of Heart Tissue Enabled by Azo and timsTOF Pro

  Azo和timsTOF Pro实现了少量心脏组织的超快和可重复的蛋白质组学

4D3

期刊: J Proteome Res,发表时间:2021.04,影响因子:4.466

研究背景:

  基于全局自下而上质谱 (MS) 的蛋白质组学广泛用于蛋白质鉴定和定量,以全面了解蛋白质组的组成、结构和功能。然而,传统的样品制备方法非常耗时,通常包括过夜胰蛋白酶消化、广泛的样品净化以去除与 MS 不相容的表面活性剂,以及在在线液相色谱-串联质谱 (LC-MS/MS) 之前进行离线样品分级以降低蛋白质组复杂性) 分析。因此,需要一种快速、稳健且可重复的方法,用于从复杂蛋白质组中进行蛋白质鉴定和定量。

研究思路:

4D4

研究结果:

4D5

图 从少量组织中进行可重现的蛋白质鉴定和定量

研究结论:

  作者开发了一种超快的自下而上的方法,用于定量和可重复地分析人类心脏蛋白质组。流程采用快速(30 分钟)胰蛋白酶消化而不牺牲蛋白质组覆盖率或可重复性,并且可以轻松缩小到少量组织从而实现了深度蛋白质组覆盖。

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